Il Dipartimento di Scienze Mediche nasce il 01/10/2012 in applicazione della Legge 240/2010 ed in conformità con lo statuto dell'Università degli Studi di Ferrara, in vigore dal 15 Aprile 2012.

Nel nuovo Dipartimento di Scienze Mediche sono confluite alcune delle attività didattiche precedentemente gestite dalla Facoltà di Medicina e Chirurgia ed alcune delle attività di ricerca dei precedenti Dipartimenti di Medicina Clinica e Sperimentale, Medicina Sperimentale e Diagnostica e Scienze Biomediche e Terapie Avanzate.

Il Dipartimento contribuisce all'attività didattica di tutti i corsi interdipartimentali coordinati dalla Facoltà di Medicina, Farmacia e Prevenzione.

Il Dipartimento, nella recente valutazione della qualità della ricerca effettuata dall'ANVUR (periodo 2004-2010), ha ottenuto la posizione 9 su 219 per la ricerca biomedica.